История Службы защиты государственной тайны Вооружённых сил России началась 13 ноября 1918 года, когда в молодой Красной армии появилось первое шифровальное отделение. В те годы информацию передавали по телеграфу и закрывали шифрами.
В межвоенный период советские инженеры изобрели шифровальную машину. Стратегические шифры Красной армии оказались настолько сложными, что с ними не смогла справиться ни одна разведка мира, а в 1941 году центральным органом стало Восьмое управление Генерального штаба. В годы Великой Отечественной войны без работы шифровальщиков ни один приказ Ставки не дошёл бы до фронта, а планы операций стали бы открытыми для противника.
После распада СССР службу видоизменили и переименовали. В 2003 году появилась Служба защиты государственной тайны, объединившая режимные, шифровальные органы и подразделения ремонта техники.
Сегодня в её структуру входят подразделения засекречивания космических радиолиний, криптографического анализа и удостоверяющие центры электронной подписи. Служба занимается предотвращением утечек, антивирусной защитой военных объектов и систем и обеспечивает безопасность информации.
С 2020 года 13 ноября официально отмечается как День службы защиты государственной тайны приказом Министра обороны № 698. В этот день чествуют нынешних офицеров и ветеранов, чьи имена долгие годы оставались в тени.